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1．针对动物病情合理选择药物：
药物的选择性作用决定了,任何药物都有各自的适应症.每种抗菌药。在疾病确诊后必须按适应症选择作用强、临床疗效好、不良反应少的药物。
如抗菌药的使用是对疾病的对因治疗，正确诊断是合理选择抗菌药物的前提，对动物的病因没有确切的诊断结果，使用抗菌药就显得无的放矢。在诊断疾病过程中，细菌学的诊断针对性更强，细菌的药物敏感性试验及联合药敏试验与临床疗效的符合率约为70％-80％。在临床应尽可能作细菌学的分离鉴定和药敏试验。
2．严格控制合适的剂量：
剂量是指药物的用量，它是决定药物效应的关键因素。在一定范围内，剂量愈大，药物在体内的浓度愈高，效应也愈强。但是如超过一定的剂量范围就可以由量变引起药物作用质的变化，发生中毒，甚至死亡。
临床用药为了安全而又有效，常采用比最小有效量大些，比极量小些的剂量，作为治疗量或常用量。对此，药典上都规定有一定的剂量范围。药典对毒药、剧药还有极量的规定。除非在特殊情况下，一般应用以不超过极量为宜。
如抗菌药在机体内要发挥杀灭或抑制病原菌的作用，必须在靶组织或器官内达到有效的浓度，并能维持一定的时间。因此一定要选择能吸收且能到达感染部位的药物，且要保证充足的剂量，迅速达到有效血药浓度。如细菌性脑部感染首选磺胺嘧啶，是因为该药在脑脊液中的浓度高。抑菌药磺胺首次量应加大，并根据在体内血中有效浓度的时间，安排用药次数、维持剂量及适宜的疗程。停药过早容易复发和产生耐药性。
此外，兽医药理学提倡按药物动力学参数制定给药方案，特别是对使用毒性较大，用药时间过长的药物，最好能通过血药浓度监测，作为用药的参考，以保证药物的疗效，减少不良反应的发生。
3．选择合适的给药途径：
合适的给药途径是药物取得疗效的保证，也是抢救危急病畜成功的关键因素。给药途径应根据药物本身的特性、剂型和病情的需要而定。注射剂常用于急性严重病例或内服吸收缓慢的药物；内服剂型常用于慢性疾患，特别是消化道感染或驱虫；局部给药多用于子宫、乳管内注入或眼、耳内滴入。
4．要有足够的疗程：
药物在体内不断的代谢，足够的疗程才能保证有效血药浓度的时间，达到彻底消除病因的效果。疗程的长短应根据病情的长短而定。一般传染病和感染症应连续用药3～5d，直至症状消失后再用l～2日，切忌停药过早而导致疾病复发。对某些慢性病或特殊病，如结核病、马鼻疽等，则应根据病情需要而延长疗程。
5.注意药物的不良反应：
药物的不良反应有毒性作用、副作用,变态反应,二重感染和后遗效应等。应用药物治疗动物疾病的过程中，既要密切注意药效，也要注意可能出现的不良反应。肝、肾功能不全的患病动物在使用易引起肝脏代谢或肾脏消除的药物时，应调整给药剂量或延长给药时间间隔，尽量避免药物的蓄积中毒。体质差的动物、老龄和幼龄动物的用药剂量应适当减少，处于妊娠期动物的用药，应考虑药物是否会影响到仔畜的发育；此外，随着畜牧业的高度集约化，应注意大量使用抗菌药造成的动源性食品中药物的残留，和饲养场排泄物中药物造成的污染问题。

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