在什么时候接种什么样的疫苗，是养禽者最为关注的问题。没有一个免疫程序是通用的，而生搬硬套别人现成的程序也是不一定能获得最佳的免疫效果，唯一的办法是根据本场的实际情况，参考别人已经成功的经验，结合免疫学的基本理论，制定适合本地或本场的免疫程序。在制定免疫程序时，应着重考虑下列因素：

本地禽病疫情 本地禽病疫情，尤其是本场的疫情，是制定免疫程序的关键。本场病史及目前仍有威胁的传染病对本地、本场尚未证实发生的疾病，必须证明确实已受到严重威胁时才能计划接种，对强毒型的疫苗更应非常慎重，避免疫苗免疫时带来的新病毒毒株对本地或本场其他未免疫同类疫苗的鸡群构成威胁。

家禽的用途及饲养期 例如种鸡在开产前需要接种传染性法氏囊病油乳剂疫苗，而商品鸡则不需要。肉鸡免疫法氏囊时选择疫苗应注意和本地毒株相符，否则易引发法氏囊疾病疫情。主要对于种鸡而言，应根据饲养地疫情及时加强免疫，提高商品鸡苗的母源抗体，防患于未然。

母源抗体的影响。鸡马立克氏病、鸡新城疫和传染性法氏囊病疫苗血清型选择时应认真考虑，母源抗体高时，不易免疫过早。

种属差异 不同种类的家禽以及同一种类内的不同品种对某些疾病抗病力不同，例如；土鸡、蛋鸡、种鸡、三黄鸡、肉鸡，由于其本身的原因，对传染病的抵抗力有所不同。

疫苗之间的干扰 如果接种时间安排不合理，不同疫苗之间会产生一定的干扰。如新城疫和鸡痘疫苗若同时使用，就会产生一定的干扰。疫苗毒株血清型、亚型或毒株。所选择的疫苗要尽可能和本场毒株的血清型、亚型相符合。疫苗剂型的选择，例如活苗或灭活苗、湿苗或冻干苗、细胞结合型和非细胞结合型疫苗之间的选择等，根据鸡只的大小、用途、合理选用疫苗。